В Туркестане XX столетия отношения между коренными жителями и русскими поселенцами складывались крайне напряженные. Связано это было с тем, что последние получали в свое пользование крупные земельные участки. Не менее острым был и религиозный вопрос.
В соответствии с июньским указом, на тыловые работы привлекались мужчины в возрасте от 19 до 43. Месяцем позже от набора были освобождены служащие полиции, имамы и муллы, студенты, должностные лица и лица, пользующиеся правами дворян. Указ о трудовой мобилизации породил множество слухов. Так, в частности, утверждалось, что мусульман собираются использовать в качестве «пушечного мяса» на фронте — якобы они должны были идти впереди русских войск и стать главной мишенью для противника. В Туркестане начались волнения, участниками которых стали преимущественно молодые мужчины. Расправы с русской администрацией, нападения на банки и почту, обрыв телеграфной связи, поджог деревень — восстание охватило Ферганскую, Сырдарьинскую и Самаркандскую области. Крупным очагом восстания стал Ташкент. «В Ташкенте жители стремились привлечь на свою сторону военнопленных и лиц, настроенных против царизма», — докладывал полицмейстер города. В некоторых населенных пунктах восстанием руководили духовные лица, пользующиеся у местных жителей огромным авторитетом.
В русских поселениях, на которые нападали повстанцы, оставались десятки изуродованных трупов — как взрослых, так и детей. Девушек и девочек уводили в плен. «Детей разбивали о камни, разрывали, насаживали на пики и вертели. Более взрослых клали в ряды и топтали лошадьми. Если вообще страшна смерть, то подобная смерть еще страшнее», — приводит «Российская газета» свидетельство настоятеля Покровского прихода Туркестанской епархии Е. Малаховского.
В Семиречье, по оценкам современников, было сожжено 1300 усадеб. Всего здесь проживало до 200 тысяч русских. Не менее 2325 из них погибли. Историки до сих пор не пришли к единой оценке событий 1916-го года; ряд специалистов утверждает, что в Среднеазиатском восстании прослеживается турецкий след. Говорится, в частности, о косвенном влиянии младотурецкой революции 1908 года, в ходе которой получили широкое распространение идеи панисламизма. Некоторые исследователи говорят о том, что в Туркестане работала турецкая разведка, здесь распространялись листовки на турецком языке, которые призывали всех благоверных мусульман объединиться против русских.
В подавлении восстания были задействованы около 30 тысяч человек. В августе волнения идут на убыль, не менее 100 тысяч киргизов и казахов бегут в Китай. Многие из них погибли, оказавшись в чужой стране без жилья и средств к существованию. В итоге к трудовой повинности вместо 400 тысяч местных жителей были привлечены 100 тысяч. В крае начались судебные процессы, продолжавшиеся до февраля 1917-го. 201 человек был приговорен к смертной казни.