Приступ гнева султана Ибрагима I Безумного закончился тем, что больше двадцати лет турки не могли взять венецианскую крепость (осада Кандии вошла в историю как самая долгая). Вспыльчивость султана вызвали очередные нападения рыцарей-госпитальеров на турецкие корабли. Обладая иным характером, Ибрагим мог бы и проигнорировать пиратство, но не зря же он получил свое прозвище. Впрочем, рыцари действительно уже давно испытывали турецкое терпение.
Госпитальеры (они же иоанниты, они же — рыцари Мальтийского ордена), создали свой военно-религиозный орден еще в 1099 г. для защиты христиан в Святой земле, и после эпохи крестовых походов они стали своего рода атавизмом. В 1291 г. госпитальеров окончательно изгнали с Ближнего Востока. Сначала они обитали на Кипре, затем на Крите, Родосе и Сицилии, пока не осели наконец в 1530 г. на подаренной им Испанией Мальте. Чтобы как-то оправдать свое существование и поддержку европейских монархов, госпитальеры взяли на себя задачу борьбы с мусульманскими пиратами в Средиземном море. Но так как орден составляли рыцари, воплощавшие дух прежних времен, то и прежние свои цели они не оставили и все еще считали, что обязаны убивать мусульман везде, где только смогут. Особенно хорошо следовать этому убеждению удавалось тогда, когда им самим (борцам с пиратами) представлялась возможность ограбить неверных мусульман. Так что рыцари еще с XIII в. с удовольствием и совершали пиратские рейды на египетское, ливанское и сирийское побережье, и захватывали турецкие корабли.
Так случилось и в октябре 1644 г.: шесть кораблей госпитальеров захватили турецкий конвой из 8 судов, следовавший в Стамбул. В бою погибло 600 турок и 120 мальтийцев. Оказалось, захваченные суда принадлежали самому султану, и помимо прочих богатств были похищены его гаремный евнух, любимая рабыня Бассеба и ее ребенок Осман, с которым Ибрагим любил играть. Рабыня и евнух вскоре погибли, а мальчика впоследствии обратили в католичество (он стал потом доминиканцем, отцом Оттоманом). Но пока что госпитальеры отправились на принадлежавший Венеции Крит, где и принялись сбывать добычу. Несколько раз венецианцы просили их уйти, чтобы не провоцировать турок, но рыцари к просьбам не прислушивались. И, конечно же, султан все узнал.
Ибрагим I рассудил, что хоть Мальту взять очень непросто, но и спускать дерзость рыцарей никак нельзя. И решил обрушиться на старых конкурентов Османской империи в Средиземном море и пособников пиратов — венецианцев, позволивших госпитальерам продавать украденное и укрываться на своей территории. Несмотря на попытки Венеции сохранить десятилетиями удерживавшийся мир, война с Турцией все же разразилась в 1645 г. Справедливости ради, госпитальеры не оставили венецианцев одних и тоже участвовали в последовавшей войне (прежде всего, отправляя им на помощь военные корабли).
В 1645 г. на Крите высадилось возглавляемое Юсуф-пашой 60-тысячное турецкое войско. Одна за другой сдались венецианские крепости на пути турок (Ла Канеу, Реттимо), и постепенно они заняли весь остров, кроме небольшого участка с крепостью Кандией. К ней Юсуф-паша подошел к 1648 г. В том же году жертвой дворцового переворота стал султан Ибрагим, но начатую им войну с Венецией было уже не остановить.
Кандия представляла собой сильную крепость — блокировать ее туркам удалось только с суши, и венецианский гарнизон (чуть больше 3 тыс. человек) хорошо снабжался по морю. Периметр стены составлял 4,5 км, а их толщина в некоторых местах — десятки метров. Открытый штурм этой крепости бастионного типа, перед которой все простреливалось перекрестным огнем, был безуспешен, а потери турок — огромны. Пришлось им осаждать Кандию, сооружать окопы и укрепления, устанавливать батареи и вести минную войну. Впрочем, довольно скоро венецианский флот отрезал турецкие коммуникации, и снабжение осаждающих стало нерегулярным. Так что и осаждали Кандию слабо, лишь изредка обстреливая.
Такое положение сохранялось много лет, пока в 1657 г. туркам не удалось потеснить венецианцев на море и восстановить полноценную доставку провианта, оружия и подкреплений. Два великих визиря (Мехмед Кёпрюлю и Ахмед Кёпрюлю) еще 12 лет осаждали Кандию: рыли подкопы, вели артобстрелы, пытались насыпать дамбу (чтобы перерезать морское снабжение гарнизона). Враги придумывали всякие жестокие методы борьбы, один изощрённее другого. К примеру, греческий историк Е. Таллсину исследовала письма времен этой войны и пришла к выводу, что осажденные хотели применить против турок биологические оружие: подбросить им одежды, пропитанные жидкостями из тел умерших от чумы. Реализовали ли этот план, неизвестно (вполне возможно, что да).
Особенно жестоким был последний этап осады. В 1668−69 гг., когда турки взяли за дело особенно серьезно, у стен крепости погибло, по разным данным, 100−108 тыс. турок и 29 — 35 тыс. осажденных (включая 280 венецианских аристократов). Обе попытки деблокировать крепость (в 1666 и 1669) не увенчались успехом. В 1669 г. на помощь Венеции прибыли французские войска (более 6 тыс.), но и они очень быстро потерпели поражение и ушли с острова. Командующий Ф. де Бофор погиб. К концу кровопролитных сражений от крепости уже остались почти одни руины. Да и от армий тоже. Армия турок еще насчитывала более 10 тыс. человек на острове, но гарнизон христиан — лишь около 3,5 тыс. Дальнейшую оборону в условиях, когда турки могли доставлять пополнения, венецианцы сочли бесперспективной и ненужной (потери территории и доходов можно было компенсировать на материке).
И тогда начались переговоры сторон (6 — 27 сентября 1669 г.). Венецианский полководец Франческо Мозорини договорился с визирем Ахмедом Кёпрюлю об условиях почетной капитуляции гарнизона: защитники крепости вышли из нее свободно, с личным оружием и пожитками в руках. Победителю, помимо руин, досталась крепостная артиллерия. Самая долгая осада в истории, длившаяся 21 год (1648 — 1669), наконец завершилась.
В результате проигранной Венецией войны за Кандию Крит стал турецким владением и оставался им до 1898 г. Интересы мальтийских рыцарей, заваривших эту кашу, не пострадали.