Современный герб Северска — ЗАТО в Томской области — принят в 2004 году.
Центральный образ эмблемы обозначает атомное производство, за счет которого существует и развивается город.
Оливковый венок символизирует мирный характер автома.
Синий — цвет Севера, зимы, снега; белый — мира, невинности и чистоты.