Современный вариант герба принят 23 апреля 2003 года.
Скипетр, увенчанный государственным орлом, символизировал монархическую царскую власть, а также, что Санкт—Петербург — столица Российской империи. Два серебряных якоря, из которых один — двухлопастный, с перекладиной у кольца — морской, другой — четырёхлопастный, с кольцом — «речная кошка», означали, что город — морской и речной порт. Якоря выражают идею Петра I о выходе к морю через речные пути. Красное поле щита напоминает о кровопролитных боях со шведами во время Северной войны.